Oltre che per una grande facilità di approccio alla materia, l'opera si caratterizza per un progetto didattico unitario che affida all'attività sperimentale notevole importanza con brevi e semplici esperimenti (Attività). Si avvale di un apparato di verifica formativa e di autocontrollo molto puntuale e strutturato per abilità e competenze.
La mela di Newton si presenta in due configurazioni: una basata sulla suddivisione in anni scolastici, l'altra tematica.
Nei tre volumi annuali le unità sono raggruppate in temi più generali, presentati da una breve introduzione e da una sintesi dei principali concetti.
Nei volumi tematici, la successione delle Unità segue invece un percorso lineare, che conduce l'allievo ad affrontare gradualmente la materia di studio, fino a comprenderne i più complessi collegamenti